همانطور که حدس زده می‌شد اخراج مربی دروازه‌بان‌های بایرن مونیخ حسابی جنجالی شده و مانوئل نویر را ناراحت کرده است. او دربخشی از مصاحبه اخیر خود با یک رسانه آلمانی، به صورت آشکارا از تصمیم باشگاه بایرن مونیخ مبنی براخراج تونیتاپالوویچ انتقاد کرد. او در این مورد گفت: «این اتفاق، شوک بزرگی به من وارد کرد همان‌طور که برای تونی هم این گونه بود و اصلاً متوجه نشدم چرا چنین اتفاقی رخ داد.» دروازه‌بان بایرن که اینک به دلیل مصدومیت شدید در حین اسکی، دور از میادین است، افزود: «تونی نه‌تنها برای من، بلکه برای همه دروازه‌بان‌های بایرن یک مربی ایده‌آل بود. او همیشه کنار ما و کمک حال ما بازیکنان بود. او11 سال و نیم برای تیم زحمت کشید و شایسته چنین رفتاری نبود.» نویر در ادامه انتقادات خود با لحنی تندتر گفت: «این یک اتفاق تکان دهنده بود که قلب من را به درد آورد. با اتفاقات بسیاری مواجه شده‌ام، اما این احمقانه‌ترین اتفاقی بود که در طول دوران حرفه‌ای تجربه می‌کنم.»
تونیتاپالوویچ که در دوران هانسی فلیک با یک رتبه ترفیع، از مربی دروازه‌بانان، به دستیار سرمربی تبدیل شده بود، بعد از حضور یولیان ناگلزمان در رأس کادر فنی بایرن، به پست قبلی خود برگشت و در ادامه نیز به دلیل اختلاف نظر با این مربی جوان از کادر فنی کنار گذاشته شد. برخی می‌گفتند پالوویچ چینش بازیکنان بایرن را به رسانه‌ها لو می‌دهد.